Von Pensionskassen unterscheiden sich Pensionsfonds vor allem in den Richtlinien für die Kapitalanlage. Bei Pensionskassen müssen mindestens 70 Prozent in mündelsichere festverzinsliche Wertpapiere fließen. Bei Pensionsfonds jedoch lediglich 30 Prozent. Fonds bieten zwar größere Ertragschancen, bergen jedoch auch deutlich höhere Risiken. Pensionsfonds sind sowohl für eine private kapitalgedeckte Vorsorge, als auch für die betriebliche Förderung geeignet.
Rentenpflichtversicherte Arbeitnehmer können mit eigenen Einzahlungen in einen Pensionsfonds die "Riester-Förderung" in Anspruch nehmen und hierdurch entweder eine Zulage oder einen zusätzlichen Sonderausgabenabzug kassieren. Der Sonderausgabenabzug richtet sich nach der Beitragsbemessungsgrenze. Im Jahr 2002 können bis zu 1 Prozent dieser geltend gemacht werden. Ab dem Jahr 2008 dann 4 Prozent.
Die eigentlich in den Bereich der privaten Altersvorsorge gehörende Riester Rente kann auch als betriebliche Vorsorge, zum Beispiel als Direktversicherung genutzt werden. Pensionsfonds sind nicht alleine wegen der Riester Rente lukrativ. Innerhalb der betrieblichen Altersvorsorge, vor allem für die Entgeltumwandlung, spielen sie eine wichtige Rolle. Seit dem Jahr 2002 können Arbeitnehmer bis zu 4 Prozent ihres Gehaltes in eine Betriebsrente umwandeln. Pensionsfonds sind dann entweder für den Arbeitnehmer in Höhe von bis zu 4 Prozent der gültigen Beitragsbemessungsgrenze steuerfrei, oder Einzahlungen werden mit dem individuellen Steuersatz der Arbeitnehmer belastet.
Es kann für bestimmte Zeiträume oder Lebensumstände auch günstiger sein, innerhalb der betrieblichen Altersvorsorge den Durchführungsweg zu wechseln. Seit 2002 kann angesammeltes Kapital aus einer Pensionszusage oder Unterstützungskasse auf einen Pensionsfonds übertragen werden.
Der Arbeitnehmer bleibt hiervon steuerlich unberührt, was wichtig ist sofern dieser eine sozialversicherungsfreie und mit Aktienfonds rückgedeckte Pensionszusage nutzen will. Ab dem Jahr 2009 kann die Umstellung auf einen zulagengeförderten Pensionsfonds dann aber günstiger werden.